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Toxicity prediction tool(derek)
 
 
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새로운 분자 표현법(Rendering)으로 고화질의 그래픽을 구현하여 완벽한 OpenGL 모델을 구현 가능하게 합니다.

 
이전의 8가지 기본적인 색으로만 표현할 수 있었던 분자 및 background를 16 million 종류의 색으로 표현 가능해 졌습니다.
HyperChem 의 분자 표현법(rendering)은 분자의 일부분을 다른 rendering 으로 지원해 줍니다. 즉, 원자들을 stick, balls, ball and stick 등의 표현법으로 나타내 줍니다.
또한, 새로운 "tube" rendering을 이용해 원자를 표현할 수 있습니다.
HyperChem에서 단백질 구조를 다루는 기능이 매우 향상되었습니다. HyperChem 은 Helix, Sheet, Turn 그리고 Coil, 네 가지 단백질 2차 구조를 지원하며, 새로운 2차 구조 표현법은 단백질을 부분적으로 선택하여 색상 및 rendering 변경을 가능하게 해줍니다.
HyperChem 은 분자 파일에서 단백질 2차 구조 정보를 인식 및 지원합니다. 단백질 데이터베이스 파일(PDB) 은 HIN 파일로 지원되며, peptide builder 는 모든 잔기(residue) 들에 대한 2차 구조 정보를 지원합니다.
Ribbon line, narrow ribbon sheet, thick ribbon sheet, encompassing helical cylinder, coil 등 다양한 단백질 2차 구조 표현 및 잔기(residue) 들의 고유 색 표현이 가능해 졌습니다.
Peptide builder를 이용하면 기존의 alpha helix, beta sheet 뿐만 아니라, beta turn, (anti-)parallel beta sheet, left-handed alpha helix, 3_10helix, pi-helix 까지도 모두 표현 가능해졌습니다.

속도가 향상된 새로운 계산 방법을 이용하면 전자밀도(electron density) 또는 정전기적 포텐셜(electostatic potential) 계산 및 디스플레이를 매우 빠른 속도로 가능하게 해주어 거대 분자 계산에서도 실용적으로 이용될 수 있습니다.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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