1.  시스템 요구 사항

l  운영체제

Windows 7 or later

macOS 10.8 or later

Ubuntu Linux 14.04 or later

Fedora Linux 21 or later

l  Memory         1 GB RAM

l  Hard Disk     250 MB available disk space

l  Display         1024 x 768 or higher

2.   제품소개

SnapGene은 종이에 그리는 것보다 사용하기 쉬운 최초의 분자 생물학 소프트웨어입니다. 이제 귀하의 연구실에서 만들어진 모든 DNA 구조를 전자 형식으로 문서화 할 수 있으며 SnapGene Viewer를 이용해 파일을 전 세계의 동료들과 공유 할 수 있습니다.

l  In-Fusion® Cloning

Clontech의 In-Fusion® 복제는 완벽한 유전자 융합을 만드는 탁월한 방법입니다. SnapGene은이 절차를 시뮬레이션 한 최초의 소프트웨어입니다. 융합 할 DNA 조각을 선택하면 SnapGene이 프라이머를 디자인합니다.

l  Gibson Assembly®

많은 연구자들이 Gibson Assembly로 제한 효소를 사용하지 않고 플라스미드에 단편을 삽입하려고합니다. 결합 된 DNA 절편은 PCR에 의해 증폭되어 중첩 된 말단을 생성합니다. SnapGene은 Gibson Assembly 반응 계획을 단순화하고 프라이머 디자인을 자동화합니다.

l  Restriction Cloning

SnapGene의 고유 한 Restriction Cloning 인터페이스는 깨끗한 레이아웃에서 필요한 정보를 표시합니다. 복제 절차 계획은 결코 단순하지 않았습니다. 하지만 원하는 것을 이미 알고 있다면 SnapGene에서는 복제 시뮬레이션에 몇 초 밖에 걸리지 않습니다. 복제 절차에 설계 결함이 있는 경우 시뮬레이션 중에 오류를 포착하고 수정할 수 있습니다.

l  PCR & Mutagenesis

프라이머를 디자인 한 후에는 기존 PCR, overlap extension PCR 또는 돌연변이 유발을 시뮬레이션하는 데 사용할 수 있습니다. 그 결과로 얻어진 DNA 시퀀스 파일은 추가 조작을 위해 즉시 사용할 수 있으며 Restriction Cloning 인터페이스처럼 프라이머 중심의 인터페이스를 통해 주요 정보를 직관적으로 표시합니다.

l  Automatic Documentation

SnapGene의 가장 놀라운 점은 복제 프로젝트의 단계를 자동으로 기록한다는 것입니다. 시퀀스를 편집하거나 복제, PCR 또는 돌연변이 유발을 시뮬레이션 할 때마다 절차가 그래프로 자동으로 기록됩니다. DNA 구조의 생성을 시뮬레이션 한 후에, History를 실험 프로토콜로 사용할 수 있으며, 최종 파일에 포함 된 모든 상위 구성 요소는 각각 별도의 파일로 생성 할 수 있습니다.

l  Agarose Gel Electrophoresis

SnapGene은 고급 알고리즘을 사용하여 사실적인 아가로 오스 겔 시뮬레이션을 만듭니다. 제한 단편은 시뮬레이트 된 젤, 숫자 목록 및 시퀀스맵 세 가지 형식으로 표시됩니다. 시뮬레이션 된 젤을 사용하여 진단 restriction digest를 계획하거나 실제 젤 이미지와 예측 된 패턴을 비교할 수 있습니다.

l  Enzyme Sites

SnapGene은 메틸화에 의해 차단 된 사이트를 자동으로 표시하여 명확한 방식으로 제한 사이트를 강조 표시합니다. 간단한 컨트롤을 통해 "Unique Cutters"와 같은 유용한 Enzyme sets를 선택하거나 Custom enzyme sets 및 선호하는 공급 업체를 정의 할 수 있습니다. Restriction Enzymes 창은 수백 가지의 Commercial enzyme들에 대한 자세한 특성을 보여줍니다.

l  Features

SnapGene을 사용하면 DNA 서열에 주석을 달기가 매우 쉽습니다. SnapGene 형식은 GenBank 표준과 일치하지만 색상, 방향성 및 세그먼트와 같은 옵션을 추가할 수 있습니다. 코돈을 시각화하고, 아미노산 번호 매기기를 추적하고, 유전자 융합에 대한 판독 프레임을 확인할 수 있도록 코딩 순서가 번역됩니다. 기능은 다른 파일에서 가져 오거나 사용자 정의 가능한 목록에서 자동으로 주석을 달 수 있습니다.

l  Primers

SnapGene은 프라이머 설계 및 시각화를위한 혁신적인 도구를 제공합니다. 다른 많은 프로그램과 달리 SnapGene은 엄격한 열역학적 알고리즘을 사용하여 용융 온도와 duplex alignment를 계산합니다. Primer를 사용하여 PCR, 돌연변이 유발 및 In-Fusion® 복제와 같은 절차를 시뮬레이션 할 수 있습니다.

l  Open Reading Frames (ORFs)

버튼을 누르면 시퀀스의 잠재적 ORF가 맵 및 시퀀스보기에 표시됩니다. 다양한 옵션들을 사용하면 ORF 매개 변수를 조정하거나 전체 시퀀스 번역을 표시 할 수 있습니다.

l  Large Sequences

게놈 시대에 분자 생물학 소프트웨어는 염색체 크기의 서열을 처리 할 수 ​​있어야 합니다. 독점적인 MICA 알고리즘 덕분에 SnapGene을 사용하여 수천 개의 주석 기능이 있는 대규모 시퀀스를 탐색 할 수 있습니다. 지능적인 검색 및 확대 / 축소 컨트롤을 사용하면 염색체를 쉽게 탐색 할 수 있습니다.

l  Versatile Data Import and Export

SnapGene은 DNA 시퀀스와 주석을 모두 캡처하는 많은 공통 파일 형식을 읽을 수 있습니다 . 지원되는 형식 목록에는 ApE , DNASTAR® Lasergene , Gene Construction Kit® , GenBank , MacVector , Vector NTI® 등이 포함됩니다.